农作物专业有机肥作为有机肥施用于农作物，不会对农作物产生很大的病虫害影响，但若农作物专业有机肥不被处理或腐熟而直接施用到作物上，则就会存在很大的危害。直接施在土壤里，农作物专业有机肥在合适条件下发酵并产生大量的热，会烧毁作物根系。因此须将农作物专业有机肥进行无害化处理后或完全腐熟后才能施用于作物上。鸡粪处理的方法有很多，传统方法是将鸡粪密封堆沤，进行厌氧发酵，一般需要3~4个月才能腐熟，现在通过新的生物技术，采用厌氧发酵的方法，腐熟速度比传统的要快10倍~20倍，将鸡粪的蛋白质等的大分子物质分解成小分子物质，作物可直接吸收。腐熟完全的鸡粪基本上是闻不到臭味的。也可以用尼龙薄膜将鸡粪盖住，大约一个星期左右即可，这样可以起到杀死病菌的效果。作物施有机肥不可太单一，必须根据土壤及果树在不同的生长期进行合理施肥。

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